eso es como todo, los ingenieros investigan y las marcas fabrican. Se posicionan por motores, potencias, precios, consumos etc. ¿cuantas veces has oido hablar del 1.9 TDi del grupo vag? Pues este motor ha montado variantes de 90, 100, 105, 110, 115, 130 y 150 cv y con muy poquitas modificaciones pero claro entre el 90 y el 150 hay otras diferencias (por ejemplo no hay 60 cv de diferencia sino que normalmente serian 35 o 40 solamente) y una cosa es lo que homologuen y otra lo que en realidad da el coche en banco. pero vamos que es una manera de homologar unos consumos inferiores, menor consumo de emisiones y de esta forma poder ofrecer un precio mas competitivo.
En cuanto a lo tuyo, pues mira, anterior al tuyo esta el que es como el tuyo que con solo un intercooler y poquito mas, pasa de 82 teoricos a 100 teoricos. en esos tiempos, ya salian los 2.0 de gasoil con potencias de entre 110 y 130 cv, con lo cual seguramente los apretaron poco.
Yo segun mi experiencia es que es recomendable reprogramar siempre teniendo en cuenta unos estandares y unos limites y segun que se toca en la reprogramacion. Hay repros muy intrusivas que se utilizan en competicion y que logicamente sirven para eso para prestaciones puras y duras sin importar ni consumos y por supuesto nada de fiabilidad. En tu motor de 100 cv, teniendo en cuenta la cilindrada, no es para nada perjudicial que se le aumenten 25 o 30 cv, porque normalmente eso se consigue con solamente aumentar la iq (cantidad de inyeccion de combustible) sin tocar presion de turbo que es lo mas importante en estos casos aunque tampoco es que se lleve una presion de turbo exagerada.