Si la diferencia de desgaste entre ext-int no supera los dos mm. no veo problema en seguirlas usando. Si es mayor o incluso la parte más desgastada ya llega al testigo de desgaste (el TWI, un pequeño taco de goma en el surco) será mejor cambiarlas.
En cuanto a realizar el paralelo colocando las ruedas irregularmente gastadas en el eje trasero, no tiene ninguna influencia, puesto que dicho paralelo se mide sobre la llanta, no sobre el neumático.
Y el paralelo puede deformarse por muchos motivos: bordillos, baches, badenes, etc. por lo que debemos vigilar el desgaste de los neumáticos para evitar desgastes irregulares excesivos, que pueden acabar por inutilizarlos. En todo caso, es admisible una diferencia no superior al mm. entre profundidad de dibujo externo e interno. No obstante, también es cierto que hay coches más sensibles que otros, en mi caso concreto el Opel Vectra B que tuve hace años lo perdía con facilidad, en cambio el Zafi no me ha dado ningún problema con esto.
Un saludo.
