Yo creo que el problema que tienes está claro.
Cuando has vaciado el FAP, hay un error de lectura en el sensor de presión. Ahora cada vez que arranques el coche, detectará el problema. Solo hay que buscar la forma de "engañar al sensor", bien si se puede desconectar, o bien haciendo algún artilugio (puente electrico o bypass) que haga creer que el FAP está operativo y sin necesidad de hacer limpieza. También se me ocurre, meter el opcom y decir a la centralita que este coche no tiene FAP, que creo que sería lo mas simple, junto con desconectar el sensor.