Hola,
yo tengo de los dos, e-ink y LCD. Y no hay punto de comparación. Para leer, lo mejor es e-ink (tinta electrónica), lo que ocurre es que los de LCD generalmente reproducen video, etc.
No sabes como me rio en la piscina y en la playa cuando veo a la gente con sus flamantes iPAD ponendo la mano, porque con el sol no ven un carajo.
La tinta electrónica, no es una pantalla retroiluiminada, de modo que solo consume cada vez que hay un cambio de página. Yo llevo un par de años con el nook, y no me arrepiento para nada.
Luego con el tema de los formatos no hay problema, yo uso el CALIBRE. Es una biblioteca que además de de ordenarte los libros, te los convierte de formato (fb2, epub, pdf, etc).