Puede que baste con que revises la programación de los elevalunas, vamos, con los cristales subidos, deja apretado el botón de bajar hasta que bajen del todo y cuando ya estén abajo, haz lo mismo subiéndolos, es como un ascensor que se equivoca de planta, le das arriba a tope y abajo a tope y se programa.
Si te lo sigue haciendo, ya será cuestión de otro tema electrónico más complejo, como el mando del conductor del elevalunas, pero es raro.