Sobre el alternador hay escritas cientos de páginas, con muchísimos rotos.
Si haces mucha ciudad, es normal lo del FAP, que se termina atascando por parar repetidas veces la regeneración del mismo. Tener un Op-com para hacer la limpieza controlada, sería una magnifica opción.
Lo de que arranca, pero no acelera, no me suena a nada de caja de fusibles. Si puedes conseguir una segunda opinión, sería recomendables, aunque si ya lo tienes en el conce, solo te queda, que entre en garantía. Recuerda que tienes dos años mas la ampliación si la contrataste.
Suerte.